剧情围绕着男孩尼可（大卫·索兰斯 饰）的生活展开。尼可有着超乎常人的智力，他只对一件事情感兴趣，那就是下棋。卡洛斯(何塞·卡罗纳多 饰演)与科拉尔(玛利亚·莫林斯 饰演)是尼可的父母，他们看上去对儿子的反常举动担心不已。卡洛斯决定聘请一位儿童心理学家来帮助尼可。胡里奥·巴尔特兰(胡里奥·曼里克 饰演)通过下棋和尼可进行交流，他渐渐地潜入了这名男孩黑暗的内心世界，并且发现尼可的家庭关系并不像表面上那样简单。现在，留给他阻止邪恶彻底毁掉这个男孩的时间并不多了……

心中怀着新的理想告别了合众地方的同伴天桐和艾莉丝，立志成为宝可梦大师的小智带着皮卡丘来到了卡洛斯地方，在卡洛斯地方与新认识的旅行伙伴莎莉娜、希特隆、柚莉嘉三人和新的宝可梦相遇的冒险故事。