暗黑路基艾尔在引发的暗黑火花战争中用拥有让所有生物陷入时间停歇的暗黑波动将所有的奥特曼，怪兽和宇宙人变成人偶，后在突然出现的奥特曼银河导致两败俱伤，双方因能力用尽而进入沉睡状态。 人偶变成流星降落到地球上，从外国回来的礼堂光命运般的被选中为奥特曼银河的继承者，同时暗黑路基艾尔正利用着人们心中的黑暗获得邪恶力量想要复活。礼堂光决定用银河火花的力量变身成奥特曼银河保护着大家。

银河奥特曼和路基艾尔本原本是一体的，在很久以前，因为对“生命”产生了不同的想法，银河与黑暗路基艾尔产生了分歧。黑暗路基艾尔支持停止一切生命来保持永恒，而银河则支持生命是不断延续这一说法。银河平时将自身的变为火花人偶隐藏在银河火花里，银河火花作为礼堂家族的圣物被一代代传人守护着。遥远的过去，在别的宇宙中，一股未知的巨大黑暗力量，让所有的奥特战士和怪兽都变成人偶了。 散落在宇宙的人偶，变成流星降落到地球上，随着时间的流逝，直到现在。被命运选择的少年礼堂光，得到了不可思议的“银河火花”。那些变小了的怪兽和奥特战